重复序列(repeated sequence): 基因序列的多拷贝。自然状态下，重复序列并不发生失活现象，基因工程中转基因失活与多拷贝有关，它可串联排列在染色体同一位点，也可以分散在都能造成转基因失活。可能是重复序列之间通过异位配对形成染色体构型的不同染色体位置，变化，使重复序列位点染色体发生收缩(是染色质化)，从空间上阻碍了转录因子与转基因的接触，使基因处于关闭状态。
真核生物的基因组相当于基因的一 般只有一个复制DNA序列（也称单一DNA，unique sequence，single copy sequence，nonrepetitive sequence等）和具有多数反复存在的DNA顺序组成。