第三世代（Generation III），指的是第三批口袋妖怪（252~386）登场的游戏所对应的时期。

售价：4800日元（宝石系列）3800日元（火红叶绿）

平台：NINTENDO GAMEBOY advance

精灵数量：386

冒险舞台：丰缘地区（宝石），关东地区（火叶）

徽章总数：8（宝石）8（火叶）

初始主角精灵：水跃鱼（水），火稚鸡（火），木守宫（草）【宝石】，杰尼龟（水），小火龙（火），妙蛙种子（草）【火叶】

二级神兽：雷吉洛克，雷吉艾斯，雷吉斯齐鲁，拉帝亚斯，拉帝欧斯【宝石】，急冻鸟，闪电鸟，火焰鸟，雷公，炎帝，水君【火叶】

封面神兽：古拉顿（红宝石），海皇牙（蓝宝石），裂空座（绿宝石），火叶为原版红绿主角宠物

一级神兽：古拉顿，海皇牙，裂空坐【宝石】，超梦【火叶】

幻兽：梦幻，代欧奇希斯，基拉祈，凤王，洛奇亚（由于凤王和洛奇亚需要活动才能得到，所以宝石版里算作幻兽）

任天堂新型掌机GBA终于在万众期待中推出了，可是迟迟都没有正统口袋的消息。最后终于在2002年11月12日发售。本次口袋画面变化很大，接助着GBA强大的机能，使口袋又提高到了一个新的境界。宠物也从251个再次提升到386个，这次口袋取消了黑夜白天的设计，加入了时钟的概念。新的芳缘地区，新的敌人熔岩团和水舰团，新的人物，新的故事，新的神兽，新的双主角。新增加了2V2的战斗，增加了选美比赛和秘密基地。这一系列新的要素造就了红蓝宝石在GBA上的成功。为了弥补GBA不能和前代掌机联机交换宠物的弊端，2004年发售了开山之作红绿的复刻版——火红叶绿。这次的复刻版除了画面的飞跃之外，还增加了新的南方七岛地图和无线联机，同时增加了部分金银时代的宠物的捕捉地点（当然有些还是需要官方活动）。火叶通关后可与宝石系列联机交换宠物。而后发售的绿宝石则是宝石版的加强版，新增加和改动了部分剧情，无线联机，部分道馆馆主发生变化，增加了一段关于固拉多盖欧卡的海陆大战的剧情，同时增加了天空龙裂空坐的剧情，当然最吸引人的则是通关后的对战天堂——战斗边疆。

（与第二世代相比）

对应的游戏世界为丰缘地区。 新增了135只怪兽，怪兽总数达到386只。 新增了103个新技能，技能总数达到354个。 怪兽的特攻与特防彻底完全分离，特殊能力不再使用。 新增了特性系统，特性总数为77个，每只怪兽获得一至二个特性。 增加了冰雹天气。 双打对战出现。树果系统大幅改进。