即位和外交政策
公元577年（敏达天皇6年），敏达天皇派遣大别王与小黑吉士出使百济国。大别王等人回国的时候，百济王送给倭国佛教经论若干卷，律师、禅师、比丘尼、咒禁师、造佛工、造寺工等六人。敏达命人将他们安置在难波大别王寺。
公元583年（敏达天皇12年）敏达天皇下诏：“先皇钦明天皇之世，新罗攻灭任那。先皇谋复任那，不果而崩，不成其志。是以朕当奉助神谋，复兴任那！”于是倭国与百济联手，对抗新罗，但是战事没有进展。但同时倭国仍然与新罗有外交往来，接受了任那的现状。
佛教政策
公元584年（敏达天皇13年），应苏我马子之请，鹿深臣从百济带来弥勒石像一座，佐伯连也从百济带来佛像一座。苏我马子派遣司马达等和池边冰田寻找佛教修行者，在播磨国找到已经还俗的高句丽人惠便。苏我马子让惠便为师，渡司马达等的女儿司马岛出家，取法号为善信。又让善信尼为师，度了禅藏尼、惠善尼。苏我马子皈依佛法，礼敬善信尼、禅藏尼、惠善尼等三尼，在石川宅建造佛殿，弘扬佛法。
公元585年2月（敏达天皇14年），苏我马子病倒，占卜者说：“是苏我马子之父苏我稻目之时，佛像遭到毁弃的原因在作祟。”苏我马子上奏敏达天皇，取得了祭祀佛法的许可。正在此时，瘟疫流行，出现了很多死者。3月，排佛派的物部守屋和中臣胜海上奏：“这是因为信奉蕃神而引起的瘟疫”，敏达天皇下诏，废止佛法。物部守屋破坏佛殿，把佛像投入海里。物部守屋痛器苏我马子等佛教徒，命令苏我马子交出三尼。苏我马子交出三尼后，物部守屋剥下三尼的法衣，让三尼全裸并捆绑，鞭打臀部。但是，瘟疫没有根治，敏达天皇和物部守屋却都
敏达天皇河内矶长中尾陵相片
病倒了。人们纷纷说：“这是烧毁佛像的罪过。”
敏达天皇河内矶长中尾陵相片
同年6月，苏我马子的病仍然没有好，上奏请求祭祀佛法。敏达天皇仅允许苏我马子私人信仰，并释放了三尼。苏我马子叩拜三尼，建造新的佛寺，迎请佛像供养。