它已经成为真核生物细胞生物学[1]上一个重要研究生物对象超过50多年[2]，它被研究的学术主题领域相当地广，这些主题包括了遗传重组、去氧核糖核酸修复、突变、细胞周期控制、致病原理（pathogenesis）与代谢等等[3]。小巢状曲菌在它所属的曲菌属（Aspergillus）之中是少数可以经由在实验室中菌株交互减数分裂来形成有性孢子的其中一种物种。小巢状曲菌是一种雌雄同体（homothallic）真菌，这是指小巢状曲菌可以自花授粉（self-fertilize），并且在没有其他交配个体的情形下形成子实体（sporocarp，或称孢子果，fruiting body）。

小巢状曲菌的基因体，是由美国麻省理工学院和哈佛大学合设的布洛德研究所（Broad Institute）定序完成，并于2005年12月发表。小巢状曲菌基因体大小总共约有3000万个碱基对，并且据判断在总共8个染色体上总共大约包括了9,500个用来编码蛋白质的基因。

最近的研究从小巢状曲菌样本中成功分离出类似半胱天冬酶（caspase）的蛋白酶，这样的蛋白酶会在细胞凋亡时会发生作用。这些发现都在真核细胞中的线粒体演化完整性的测定上扮演了重要的角色，这个角色就像是古老的变形菌引起细胞死亡的能力。