1972年3月19日，埃及航空763次航班于越南坠毁，机上30名乘客全部遇难。
1976年12月25日，当埃及航空864次航班的驾驶员尝试调整下降速度失败后，坠落于泰国曼谷一工业综合设施。机上52名乘客中有20名丧生，地面亦有另外72人丧生。
1985年11月24日，埃及航空648号班机，一架波音737-266客机（编号：SU-AYH）被三名来至尼达尔组织（Abu Nidal Organization）的男子劫机至马尔他卢加。Omar Rezaq为当中唯一生还的劫机者。经过数小时的谈判，埃及军队强行攻入机舱，与劫机者驳火，期间劫机者引爆几枚手榴弹并枪杀了5名以色列人及美国人。飞机于爆炸及火中受到严重破坏。最后，6名机员中有2名死亡，91名乘客中亦有58名被杀。
1999年10月31日，埃及航空990号航班，一架来往纽约甘乃迪国际机场及开罗的
波音767-366客机（编号：SU-GAP）坠落于楠塔基特岛对出的大西洋水域。该航班的副驾驶员埃尔巴图迪（Gameel Al-Batouti）被美国有关当局指他进行自杀，蓄意将飞机撞毁。但埃及官员已对有关说法提出强烈质疑。
2002年5月7日，埃及航空843次航班，一架由开罗飞往突尼斯的波音737-566客机（编号：SU-GBI），在降落迦太基国际机场途中，坠毁于约6公里外的山区，3名机组人员及11名乘客死亡。
