确定了SCD源期刊包含的论文总篇数后，再按照各一级学科教学科研人员的人数比例与各一级学科论文数量比例相同的方法，分配各一级学科的论文数量，必要时需按人数核定二级学科的论文数量。最后将各学科的期刊按
影响因子从高到低顺序排列并将顺序排列的期刊论文数量依次相加，直至相加的论文总数达到该学科分配的论文数量为止。
如果某个
一级学科的期刊论文相加后超过该学科分配的论文篇数的10%，则删除该学科
影响因子最低的期刊的部分论文。删除的顺序是：首先删除文末没有参考文献的页数最少的论文，然后删除文末没有参考文献的其他论文，再删除文末附有参考文献的页数最少的论文，直至论文总数达到该
一级学科分配的论文数量为止。例如，食品科学与工程
一级学科按人数核定SCD论文652篇，但该学科入选的《食品科学》杂志2006年刊登论文1154篇，超出核定论文数502篇。按上述方法删除2006年《食品科学》杂志的502篇论文后，SCD实际收录该杂志2006年652篇论文。
如果某个
一级学科的期刊论文相加后未达到该学科分配的论文篇数的90%，则在未入选的综合类期刊中寻找该一级学科质量高的论文，直至论文总数达到该一级学科分配的论文数量为止。例如：社会学一级学科核定SCD论文1115篇。社会学一级学科下属社会学、
人口学、
人类学、民俗学4个
二级学科。其中社会学
二级学科人数占社会学一级学科总人数的60%，每年应有论文670篇。但查遍我国所有期刊，该二级学科只有《社会学研究》一份期刊。《社会学研究》杂志2006年刊登论文70篇，远低于该一级学科中的社会学二级学科分配的论文数量，故需要在未入选的综合类期刊中寻找数百篇社会学的高质量论文。这一结果也说明我国的社会学学者缺少本学科的学术交流平台。
优秀的综合类期刊(含综合性的大学学报)刊登的论文包含在SCD源期刊论文总数内。
按以上方法确定的期刊数量就是SCD源期刊的数量。
