清朝雍正元年以前，俱派理藩院司员驻扎西宁，办理民族事务。平定罗卜藏丹津事件后，简派大臣驻西宁总理之，而遣部郎协理。首任办事大臣达鼐，蒙古正白旗人，散秩大臣，雍正三年到任。办事大臣衙门，初设于察罕城（青海湖边）。然该处气候寒冷，历任大臣多不亲往，而驻西宁城内（今南大街）。乾隆二十五年（1760）曾一度撤销，二十七年复设，终清一代，延续不辍。其主要职掌，负责管理青海蒙古各旗和藏族部落。至此，整个青藏高原都纳入了清政府的直接统治之下，使清政府有可能对藏族地区行政区划重新进行调整和划定。