其间又可以分为3个时期:
自白河太上天皇建院厅至1156年保元之乱为前期,以太上天皇为核心、中级官吏(国司)为主体的院厅官僚集团,同藤原氏外戚集团相斗争,力图抑制摄关政治,伸张皇室权威;
自1156年至1179年武士平清盛幽禁后白河太上天皇为中期,院厅在同藤原氏斗争中,主要依赖平氏武士集团,平氏武士集团乘机把势力伸入中央,进而排斥院厅,抑制藤原氏,控制政权;
1179年至1192年镰仓幕府建立为后期,源、平两大武士集团间的争霸日趋激烈,院厅随着两大武士集团的力量消长,不断地改变依靠力量,权势渐衰,至源赖朝建立镰仓幕府,院政时代宣告结束。
此后,院政虽仍断续出现,但已无实权。