1994年底,邓肇坚医院设立一所全港唯一的医护人员急症科训练中心,为全香港公立医院急症科培训医护人员、消防处人员及警方飞虎队等急救护理训练。
自1998年4月1日起,邓肇坚医院及
律敦治医院的管理已经合并。2002年期间,邓肇坚医院的临床服务包括急症室及邓志昂专科门诊服务亦相继迁往律敦治医院。
2005年4月1日,邓肇坚医院正式转型
为一所社区综合医
疗中心,包括中医门诊、急症室训练中心、家庭医学训练中心、综合专科诊所、职员诊所、社康护理服务中心、健康实践中心以及其他专职医疗部门包括物理治疗部及职业治疗部。