明思宗崇祯二年（公元1629年），叛乱达八年之久的奢崇明、安邦彦叛军仍然割据在五峰山桃红坝，良柱乘其不备，乘早雾进行突袭，将奢、安叛军击溃，追击至鹅项岭，因路窗地势险要，人马不能容，叛军被歼数万人，并生擒叛酋奢崇明、安邦彦，取得了西南奇捷，使奢、安叛乱得以彻底平定。但是，负责平定奢、安之乱的兵部尚书朱燮元报功未报良柱，甚至讦奏，反解除了良柱的职务听候调查。后来，由于得到抚按和其他御史上疏其功劳，于崇祯七年（公元1634年）才得以升左都督，世荫锦衣指挥佥事。后任四川总兵官。崇祯十年（公元1637年）十月，农民起义军李自成，过天星，混天星等分三路入川，良柱拒战于绵州，众寡不敌，阵亡。