1960年，增设森林保护专业、生物物理专业、木材水运专业。1961年，经调整，生物物理、木材水运两个专业停办。1962年，森林保护专业停办。1965年，林产化学工艺专业和木材机械加工专业停办，增设林业机械专业，至此，福建林学院只保留林业、森林采伐运输机械化、林业机械化3个专业。　福建林学院于1970年撤销。1972年，与福建农学院合并复办，改为福建农林大学。1975年，农林分开办学，恢复福建林学院。　现在，全院有4个系、1个基础部、1个马列室。共有6个本科专业、2个专门化、5个专科专业、1个干部专修科和4个师资班。其中林学专业是全省九个重点专业学科之一。经济林、造林学、森林经理、林业经济等4个学科是硕士学位授予点。　福建林学院设有杉木、经济林、森工采运机械化、林产品综合利用、萜稀等5个研究室，专职科研人员27人。　全院教职工847人，校本部322名专职教师和科研人员中，教授、副教授63人，讲师95人，还聘请一批校外兼职教授。在校研究生、本专科生1600余人。　近年来，学院在厦门特区建立“窗口”，在福州建立科技与信息交流中心，并和新西兰坎特雷大学林学院、美国俄勒冈州立大学、南京林业大学建立校际友好关系，与省内一些经济部门建立协作关系。除招收本科生、研究生外，也招收相当一部分专科生、代培生、进修生、自费生、函授生，还进行专项技术的短期培训，教育对象以本省为主，遍及全国16个省区。　中共十一届三中全会以来，全院31项科研成果获得国家、部、省级科研成果奖，2项发明获国家专利，8项与外单位合作的项目获省级以上奖。近几年，学校还与生产单位签订59项成果转让或技术协作合同，为社会解决了数十个生产技术问题，还派出10多名教授、专家担任省地县建设技术顾问。1981年，该院成立“营造福建沿海绿色长城服务站”，组织学生参加营造绿色长城的社会实践。1985年，经省林业厅批准，该院成立“福建林业基地建设技术咨询中心”，开展为全省林业基地建设服务的业务。该院俞新妥教授长期从事杉木研究，取得突出成就。张建国教授长期从事林业经济研究，被省人民政府表彰为有突出贡献的科学工作者，被推选为中国林业经济学会副理事长。林学系谢卿楣、李友恭教师研究“木毒蛾核多体病毒”的成果，获得1978年全国科学大会成果奖。　福建林学院创办30年来，走过一条坎坷的发展道路。1958年，创校伊始，他们搭起临时茅棚，有的寄居开平寺内，在山区艰苦创业。1970年，福建林学院被撤销，人员全部下放，所有资产分光散尽。1972年复办时，大量校舍被工厂占用，厂校混杂。师生在困境中坚持教学，持续到1980年。现该院占地360亩，校舍建筑达8万多平方米，图书资料38万册，科研实验林和用材林5万多亩，仪器设备和各种设施已初具规模。　该院编辑出版公开发行的定期刊物有《福建林学院学报》、《林业经济问题》。　30年来，该学院培养毕业了4147名本科生、127名专科生、32名研究生。他们大都成为林业战线的技术骨干和管理骨干，不少人长期扎根艰苦的林业生产第一线。