常呈结核状或粒状产出，断面多呈鲕状或层状构造，多分布在水深小于1000米的岸外浅滩、浅大陆架上、海陆架、陆坡上部、边缘台地和海山或海台上。

主要产于非洲西岸外摩洛哥、加蓬、刚果、安哥拉、纳米比亚陆架区，北美东岸外布莱克海台、佐治亚和北卡罗来纳的陆架，美洲西岸加利福尼亚和墨西哥湾、秘鲁-智利陆架及陆坡区，西太平洋海山区和新西兰北部查塔姆海台区。

是在上升流强盛的厌氧环境中经生物化学过程沉淀而成。形成时期，主要是中新世。未来磷酸盐资源的一部分将来自海底磷钙土。

磷钙石又称磷钙土，是一种富含磷的海洋自生磷酸盐矿物，它是制造磷肥、生产纯磷和磷酸的重要原料。另外磷钙石常伴有含量高的铀、铈、镧等金属元素。据估计，海底磷钙石达数千吨，如利用其中的10%则可供全世界几百年之用。

海底磷钙石的形态有磷钙石结核、磷钙石砂和磷钙石泥三种，其中以磷钙石结核最重要。磷钙石结核是一些大小各异、形状多样、颜色不同的块体，直径一般几厘米，最大体积可达（60*50*20）立方厘米。磷钙石砂呈颗粒状，大小只有0.1~0.3mm，颇似鱼卵。

关于磷钙石的成因有许多假说，较流行的有生物成因说和化学沉淀说。综合的观点是上诉两假说被看作磷钙石形成的两个阶段：1、生物作用阶段：是大量繁殖的生物把溶解和分散在海水中的磷酸盐富集到其机体内；2、化学作用阶段：则是大量生物死亡后，在分解过程中释放出磷，交代方解石和生物残体等化学作用而形成磷钙石。磷钙石按产地可分为大陆边缘磷钙石和大洋磷钙石，前者主要分布在水深十几米到数百米的陆架和陆坡上部，常与泥、砂和含有砾石的海绿石沉积物混合在一起；后者主要产于西太平洋海山区，往往与富钴结壳相伴生。