保护区地貌上属于现代冲积性江汉水网平坦平原东缘,汉江河漫滩斜面,长江河漫滩斜面与汉阳丘陵性红土台地接合部地貌类型单一,除北部部分地区为波状平原外,其余皆为低洼平原,组成物质为河湖沉积物。海拔高程在17.5~21m之间,由多个碟形洼地复合构成。由沉湖、王家涉湖、张家大湖、黄丝河、芦苇场及消泗垸、曲口垸等组成,湖底海拔不到18m,形成江汉平原上最大的典型洪泛水湖泊,也是我国距离特大城市最近的一处重要湿地。沉湖北面黄丝河自西向东,南面东荆河(又称长河)自西向东在黄陵闸汇合流入长江。枯水期出现大片沼泽草甸,形成浅湖与沼泽草甸相连接的湿地生态系统,且各自成为系统的碟形湖泊,属于吞吐型、季节性的浅水型湖泊,为越冬水禽提供了优良的栖息环境,尤其是涉禽。属于中亚热带湿润季风气候,具有冬冷夏热,雨热同季,四季分明,雨量充沛,光照充足,无霜期长的特点。土壤分布主要以潮土、水稻土为主,在湖滩有少面积的草甸土分布。