1982年毕业于厦门大学获微生物学学士学位, 1994年毕业于美国德州休士顿大学获生物化学/分子生物学博士。1994-1996年间作为NIH博士后在美国哥伦比亚大学生化与分子生物物理系和眼科系从事博士后研究工作。

大学毕业后赴广州市微生物研究所从事工业微生物学研究。

赴美攻读博士学位期间，师从Dr. George E. Fox 从事分子生物学和分子进化研究。

获得博士学位后先后作为NIH博士后（1994-1996）和副研究员(1996-1998)， 在Dr. Abraham Spector 的指导下在美国哥伦比亚大学生化与分子生物物理系和眼科系从事转基因、基因敲除实验动物研究。

1999年起受聘为研究助理教授（1998-2002）和研究员(2002-2005), 在香港大学分子生物研究所作为PI带领研究小组开展能量代谢、糖尿病和糖尿病综合症病理发生机、肾渗透调控与肾病等方面的研究, 课题得到了包括香港政府研究资助局以及美国辉瑞公司的支持。

在香港大学课题组在眼晶状体发育与白内障发生、肾发育与肾渗透调控和肾病、糖脂代谢调控以及糖尿病和糖尿病综合症病理发生机制等方面取得不少的研究成果，曾在2004和2005 年分别获” 国际肾科学学会肾病防治大会最佳论文奖”和” 第三届世界肾科学大会APSN最佳论文奖”。2006年3月起被厦门大学引进为985平台特聘教授, 在生命科学学院生物医学科学系开展包括代谢疾病以及miRNA在人类代谢相关疾病和肿瘤中的作用与机制等分子医学领域的研究，相关项目分别得到国家重大科技研究计划（973计划）、国家自然科学基金以及福建省自然科学基金的资助。杨云青教授的研究成果分别发表在包括 JBC, Trends Mol Med， Intl J Mol Med，AJP-Cell Biol, AJP-Renal Physiol., IOVS, BBRC, Exp. Eye Res. Gene, Intl. J. System. Bacteriol 以及System Appl Microbiol 等重要国际刊物上, 目前国际SCI引用次数已超 310。