病因可分为先天性及后天性两大类。
先天性的心瓣疾病就是病人出生时已发现的心瓣毛病，大多没有明显病因，例如有些病人的主动脉瓣只有两叶，较正常的少了一叶，结果那个主动脉瓣只能够张开一点，影响血液流通。
后天性的心瓣疾病大致可分为感染、退化及其它疾病引发三类。
细菌感染：
细菌可能透过血液到达心脏内部及侵蚀心瓣，令心瓣的组织受损。有两类人较易受细菌感染，第一类是共享针筒的吸毒者，第二类是心瓣本身已有小问题(如心瓣已经较厚甚至开始钙化)的病者。
退化：
随着年龄渐长，很多人的心瓣会出现退化的现象，在主动脉瓣最常见。亦有少部分病人患上一些遗传病，如马方氏症(Marfan's Disease)，令心瓣提早退化。
其它疾病：
其它疾病主要指风湿性心脏病。引起风湿性心脏病的链球菌(Streptococcus)会令病者的喉咙发炎，而小部分的患者会出现不正常的免疫反应──身体会出现异常的抗体破坏心瓣组织，如造成二尖心瓣关闭不全或二尖心瓣狭窄。
部分病人没有明显病征，其它的则因为血液循环不良而有以下的征状：
1)体质较差，较易感到疲倦；
2)肺部可能充血，令病者呼吸不畅顺；
3)面部、手脚或其它部位肿胀；
4)腹部肿胀，因为肝脏可能会胀大；
5)感到心跳不规则，有时会突然加快。