武家势力勃兴后，平清盛曾经建立过第一个中央政权，但基本寄生于公家朝廷的组织形式，源氏消灭平氏后，决定借用“征夷大将军”一职来建立独立于公家朝廷的政权结构，自
源赖朝始，“征夷大将军”成为武士政权元首的固定官职，“幕府”成为武家政权的稳定组织架构，历代征夷大将军名目如下：
源（木曾）义仲 1184 征夷大将军。——此人是源平交替阶段的过渡人物
镰仓幕府
1 源赖朝 1192～1198
实朝死后，赖朝的嫡系断绝，幕府执权北条氏先迎公家贵族子嗣（与赖朝有姻戚关系）为将军，后又以皇族亲王为将军，将军名义上仍是幕府首脑，但实权和武家领袖的地位则由北条氏以执权的名义代代控制，实际上篡夺了
镰仓幕府的权力。
4 九条赖经 1219～1244
5 九条赖嗣 1244～1252
镰仓幕府的灭亡以北条氏京都统治机构
六波罗探题和镰仓统治机构执权的覆灭为标志，而末代的幕府将军却得以善终，守邦亲王出家后安度余生。
室町幕府
室町幕府是一个
守护大名的松散联盟，但征夷大将军自始而终都是幕府的最高权力者（只不过战国时代没人再听幕府的了）。
3 足利义満 1368～1394
10足利义稙1489～93,1508～1521
14 足利义栄 1568
注
这里有必要提到织田信长和
丰臣秀吉的安土、桃山政权。织田政权平定近畿和日本大半，废绝足利幕府，但信长并未开幕，也许是因为天下未定吧，也有认为他企求比“征夷大将军”更为尊崇的名号（日本新天皇？）。丰臣秀吉统一日本(严格意义上说,丰臣的统治只是通过同盟妥协而建立的一个相对平稳的时局,并不算统一)，但他的出身使得他无法轻易开幕，因为长期以来武士集团都认为只有源氏、平氏的子孙才有资格开幕，如同只有
五摄家能当摄政、
关白一样，麻烦多多。秀吉先冒充平氏，不成，再认五摄家之一的近卫氏的近卫前久做干爹，此后蒙天皇赐姓“丰臣”，才算当上
关白（公家朝廷的最高官），终其治世，他都没有开设幕府，当然也谈不上什么征夷大将军，他的政权结构与平清盛类似，是寄生于公家朝廷的官位体系，同时又辅以奉行等役职而运转的。
在织田信长、丰臣秀吉之间，有一个“
三日天下”的明智光秀，他出自美浓土歧源氏，以名门自居，
本能寺之变做掉信长后，强迫天皇策封了他征夷大将军，当了几天就完蛋了，也可以勉强算做过吧。
江户幕府
自丰臣秀吉死后，德川家康于关原合战中取胜，推翻丰臣政权。1603年，德川家康被任命为征夷大将军，在
江户设幕府。建立
德川幕府又称江户幕府。
1 徳川家康 1603～1605
2 徳川秀忠 1605～1623
3 徳川家光 1623～1651
4 徳川家纲 1651～1680
5 徳川纲吉 1680～1709
6 徳川家宣 1709～1712
7 徳川家継 1713～1716
8 徳川吉宗 1716～1745
9 徳川家重 1745～1760
10 徳川家治 1760～1786
11 徳川家斉 1787～1837
12 徳川家庆 1837～1853
13 徳川家定 1853～1858
14 徳川家茂 1858～1866
15 徳川庆喜 1866～1867
