宠物店的老板叶三，为讨女儿初叶开心，不惜花重金购入一只无比奇怪 而又神秘的蛋，并且亲自代孕孵化。不久，可爱的“小婴儿”--五更出生了，出人意料的是顽皮捣蛋的五更竟然是只恐龙宝宝，被出生后的额五更第一眼看到的初叶，成了五更的妈妈。淘气的五更将高谷商店街搞得不得安宁，唯一能够让它停止的是“蓝莓果酱”。由于博士的时光机实验，把初叶、五更一行人及整条高谷商店街莫名其妙地卷进了侏罗纪时代，于是大家开始了另类的冒险生活。后来，大家终于有希望回到现实世界中，不料恐龙岛却被黑暗小子侵占，变成了黑暗而恐怖的世界。

注：粤语版共51集，普通话版共48集。带#的19，28，47集普通话版没有。

1 五更的诞生

2 百厌星恐龙

3 恐龙的克星

4 恐龙看牙医

5 恐龙与时间机器

6 剪刀手恐龙

7 五更学吹笛

8 学校大混乱

9 恐龙宝宝过节

10 飞天小恐龙

11 恐龙去郊游

12 草地赛马

13 有好多恐龙啊

14 五更与恐龙家族

15 给恐龙送面

16 恐龙的礼物

17 奇幻旅程

18 五更的第一个新年

#19 谁是小偷#

19 五更与雪人

20 黄金梦

21 失常的右卫门

22 半鱼人与五更

23 川太加油

24兰华的秘密

25 奇怪的餐厅

26 外太空来的王子

#28 可爱的幽灵#

27 五更做保姆

28 赏花

29 恐龙岛诊所

30 原野写生

31 五更蓝天教室

32 半鱼人与木精灵（半鱼人之恋）

33 笑出祸

34 梦境中的教训

35 顽皮的水獭

36 宝岛历险

37 冰河时期

38 五更散步记

39 来自上游的信

40 二更的烦恼

41 美女与五更

42 恐龙岛的七夕庆典

43 胆量测试

44 五更与山猫

#47 地图伯爵#

45 使命

46 蛋里的五更

47 黑暗小子

48 永恒的友情