1992年,波斯尼亚-黑塞哥维那独立之后,塞尔维亚与黑山在4月27日重组联邦,称为“
南斯拉夫联盟共和国(Savezna Republika Ju-goslavija, SRJ)”。5月8日,JNA重新规划为“南斯拉夫军队(Vojska Jugoslavije, VJ)”,并且从波斯尼亚撤离大约14000人的部队,留下大约8000人的部队组成波斯尼亚“塞尔维亚共和国军队(Vojska Republike Srpske, VRS)”。2003年,南斯拉夫联盟共和国更名为“塞尔维亚-黑山国家联盟(Državna zajednica Srbija i Crna Gora)”,同时VJ也更名为“塞尔维亚-黑山军队(Vojska Srbije i Crne Gore, VSCG)”。并且在之后随着
黑山共和国独立,再分离出黑山军队,剩余的部分改组成塞尔维亚军队。