傅嘏於正元二年（255年）逝世，傅祗继嗣承袭 阳乡侯爵位，咸熙元年（264年）复建五等爵，傅祗因父功改封 泾原子。傅祗为人至孝，年少已知名，以才能和识见明达精练见称。

傅祗先後担任太子舍人、散骑黄门郎和荥阳太守等职，任荥阳太守期间建造沈莱堰解决影响兖豫两州黄河泛滥的问题，百姓因而为傅祗立碑称颂。傅祗後兼廷尉，又迁任散骑常侍、左军将军。

太熙元年（290年），晋武帝司马炎逝世。遗体尚未下葬，辅政的太傅杨骏却为取悦人心，打算进封众人封爵。傅祗则写信给杨骏，以皇帝新死，臣下不应论功为由反对，但杨骏不听。不久傅祗调任侍中。元康元年（291年），贾后密谋诛除杨骏，当时有宫中发生事变的传闻，洛阳宫南门云龙门封闭，杨骏召集众官到府第商议，但杨骏最终未能决定有作何行动。傅祗於是自请与尚书武茂入宫察看情形，作揖而走，其馀一众官员亦离开。当晚杨骏就被诛杀。杨骏死後，尚书左仆射荀恺因与太子少师裴楷不和，因而以裴楷儿子是杨骏女婿而将裴楷收付廷尉，而杨骏属官很多也被送到廷尉审判。傅祗不单证明裴楷无罪，又以高平陵之变後司马懿不诛杀曹爽司马鲁芝，日後更任用他为青州刺史的事例，上书表示不应一并诛除杨骏属官。最终他们都获下诏赦免。

傅祗及後改任司隶校尉，因在诛除杨骏一事的功勋而应封郡公，但傅祇坚决辞让，只接受封 灵州县公。又分原四千户食邑中的二千二百户给幼子傅畅封爵；更以原本封爵赐给侄儿傅隽，改封为东明亭侯。同年，楚王司马玮以贾后假造的皇帝诏书诛除汝南王司马亮和卫瓘，傅祗因接诏後迟疑而遭免官。一年後任光禄勋，後又因公事而免职。

元康六年（296年），氐人齐万年获秦雍两州的氐族和羌族叛民推举为主，并称帝反晋。傅祗任行安西军司，加散骑常侍，与安西将军司夏侯骏一同讨伐齐万年，但无甚进展，直至三年後才在孟观的努力下平定齐万年。战後曾先後任卫尉和散骑常侍，後加光禄大夫，门前施放行马。

永康元年（300年），赵王司马伦诛除贾后并辅政，任命傅祗为中书监，续任散骑常侍加光禄大夫，以稳定朝中众人的心。傅祗虽然以病推辞，但司马伦仍派御史带他就职。王戎、陈准等人知傅祗就任，都安心地说：「傅公在事，吾属无忧矣。」次年司马伦篡位，傅祗改任右光禄大夫、开府，加侍中。四个月後司马伦就被齐王司马冏所领的讨伐军击败并被诛杀，并迎晋惠帝复位。傅祗即以曾经受司马伦任命而请辞，但不被准许；及後廷尉以司马伦篡位时的禅让诏书出自中书省，追究中书监傅祗，但都获赦免，及後更以傅祗并非撰写诏书草稿者而恢复其光禄大夫官职。傅祗其後转任太子少傅。

光熙元年（306年），晋惠帝逝世，皇太弟司马炽（晋怀帝）即位，傅祗改任光禄大夫、侍中，不久加尚书右仆射、中书监。傅祗在当时作为首辅大臣，常常宣扬君臣之间谦让的道理，令两者之间和睦共处；同时又因通晓国家体制，亦多参与朝廷制度的事。傅祗後转任左光禄大夫、开府，行太子太傅，侍中。永嘉五年（311年）升任司徒。

同年大将军苟晞上表迁都仓垣，怀帝最终决意迁都，并派傅祗到河阴营治舟船准备怀帝水路交通之用，但怀帝碍於盗贼横行而不能离开洛阳。及後汉赵军攻破洛阳，将怀帝掳至平阳。傅祗於是与苟晞共建行台，设於河阴，以司徒、持节、大都督诸军事身份传檄四方，并派儿子傅宣与尚书令和郁向方镇长官徵集义军营救怀帝，自己屯盟津小城，命傅畅为河阴县令，等待傅宣。次年汉赵河内王刘粲进攻傅祗所驻的盟津，此时傅祗急病逝世，享年六十九岁。

字子庄。父嘏，魏太常。祗性至孝，早知名，以才识明练称。武帝始建东宫，起家太子舍人，累迁散骑黄门郎，赐爵关内侯，食邑三百户。母忧去职。及葬母，诏给太常五等吉凶导从。其后诸卿夫人葬给导从，自此始也。服终，为荥阳太守。自魏黄初大水之后，河济泛溢，邓艾尝著《济河论》，开石门而通之，至是复浸坏。祗乃造沈莱堰，至今兖、豫无水患，百姓为立碑颂焉。寻表兼廷尉，迁常侍、左军将军。

及帝崩，梓宫在殡，而太傅杨骏辅政，欲悦众心，议普进封爵。祗与骏书曰：“未有帝王始崩，臣下论功者也。”骏不从。入为侍中。时将诛骏，而骏不之知。祗侍骏坐，而云龙门闭，内外不通。祗请与尚书武茂听国家消息，揖而下阶。茂犹坐，祗顾曰：“君非天子臣邪！今内外隔绝，不知国家所在，何得安坐！”茂乃惊起。骏既伏诛，裴楷息瓒，骏之婿也，为乱兵所害。尚书左仆射荀恺与楷不平，因奏楷是骏亲，收付廷尉。祗证楷无罪，有诏赦之。时又收骏官属，祗复启曰：“昔鲁芝为曹爽司马，斩关出赴爽，宣帝义之，尚迁青州刺史。骏之僚佐不可加罚。”诏又赦之。祗多所维正皆如此。

除河南尹，未拜，迁司隶校尉。以讨杨骏勋，当封郡公八千户，固让，减半，降封灵川县公，千八百户，余二千二百户封少子畅为武乡亭侯。又以本封赐兄子隽为东明亭侯。

楚王玮之矫诏也，祗以闻奏稽留，免官。期年，迁光禄勋，复以公事免。氐人齐万年举兵反，以祗为行安西军司，加常侍，率安西将军夏侯骏讨平之。迁卫尉，以风疾逊位，就拜常侍，食卿禄秩，赐钱及床帐等。寻加光禄大夫，门施行马。及赵王伦辅政，以为中书监，常侍如故，以镇众心。祗辞之以疾，伦遣御史舆祗就职。王戎、陈准等相与言曰：“傅公在事，吾属无忧矣。”其为物所倚信如此。

伦篡，又为右光禄、开府，加侍中。惠帝还宫，祗以经受伪职请退，不许。初，伦之篡也，孙秀与义阳王威等十余人预撰仪式禅文。及伦败，齐王冏收侍中刘逵、常侍驺捷、杜育、黄门郎陆机、右丞周导、王尊等付廷尉。以禅文出中书，复议处祗罪，会赦得原。后以禅文草本非祗所撰，于是诏复光禄大夫。子宣，尚弘农公主。

寻迁太子少傅，上章逊位还第。及成都王颖为太傅，复以祗为少傅，加侍中。怀帝即位，迁光禄大夫、侍中，未拜，加右仆射、中书监。时太傅东海王越辅政，祗既居端右，每宣君臣谦光之道，由此上下雍穆。祗明达国体，朝廷制度多所经综。历左光禄、开府，行太子太傅，侍中如故。疾笃逊位，不许。迁司徒，以足疾，诏版舆上殿，不拜。

大将军苟晞表请迁都，使祗出诣河阴，修理舟楫，为水行之备。及洛阳陷没，遂共建行台，推祗为盟主，以司徒、持节、大都督诸军事传檄四方。遣子宣将公主与尚书令和郁赴告方伯征义兵，祗自屯盟津小城，宣弟畅行河阴令，以待宣。祗以暴疾薨，时年六十九。祗自以义诚不终，力疾手笔敕厉其二子宣、畅，辞旨深切，览者莫不感激慷慨。祗著文章驳论十余万言。