霰弹枪定序法（Shotgun sequencing，又称鸟枪法）是一种广泛使用的为长DNA测序的方法，比传统的定序法快速，但精确度较差。曾经使用于塞雷拉基因组（Celera Genomics）公司所主持的人类基因组计划。 霰弹枪测序法的思想是将基因组打断为数百万个DNA片断，然后用一定的算法将片断的序列信息重新整合在一起，从而得到整个基因组序列。为了提高这一方法的效率，1980年代，测序和片断信息整合达到了自动化。这一方法虽然已被用于序列长达6百万个碱基对的细菌基因组测序，但对于人类基因组中3千万个碱基对的序列测定，这一技术能否成功在当时还未有定论。