脱辅基酶蛋白（apoenzyme） 酶中除去催化活性可能需要的有机或无机辅助因子或辅基后的蛋白质部分。 在由复合蛋白质构成的酶中，特别是能利用透析和其它方法可逆地解离其低分子成分时，称蛋白部分为脱辅基酶蛋白，低分子部分为辅酶，具有两者结合催化效应的复合蛋白质称为全酶。当辅酶的结合强固时称为辅基，例如硫胺素焦磷酸是丙酮酸脱羧酶（EC 4．1．1．1）的辅酶，从全酶分离出后再加入到脱辅基酶蛋白中恢复其催化作用。NAD与其说是辅酶，不如说是底物。由于脱辅基酶蛋白的某个脱氢酶的作用而转变为它的还原型，此还原型可由其它脱氢酶等的作用而被氧化。