日本学士院（日语：日本学士院；英语： The Japan Academy），是日本的最高学术机关。其前身为东京学士会院和帝国学士院。1879年，日本仿照法兰西科学院成立东京学士会院。1906年改称帝国学术院。第二次世界大战后，1947年改名为日本学士院。1949年附属于日本学术会议。1956年脱离日本学术会议，直属日本文部科学省。该机构会员150人，由学术院选定且均为终身会员，每年领取一定的薪水。其成员分为人文科学和自然科学两部。为奖励各科学术研究，学士院每年均进行学术评议，对学术上有重大贡献者，授予日本学士院奖。对其中特别优秀者，由日本皇室亲自授予恩赐赏。