然后，考虑到知识的层次结构，蛋白质的6个状态的HMM的基础上，我们进一步提出了 层次隐马尔可夫模型 （ HHMM ），它不仅具有明确的生物学意义，但也少的转换。最后，实验表明，比较各种方法的的 HHMM 和6个状态的HMM都优于其他方法。
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层次隐马尔可夫模型
Hierarchical hidden Markov model
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