...菠萝蛋白酶等植物蛋白酶属于半胱氨酸蛋白酶，也称为巯基蛋白酶，这类酶最适pH除个别酶为酸性外在中性，可受到对氯汞苯甲酸(PCMB)的专一性抑制，但DFP、金属螯合剂对其无影响。链球菌生产的streptopain，溶组织梭菌生产的clostripain也属半胱氨酸蛋白酶。
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指直接作用ATP酶抑制磷酸化作用的试剂，如二环己基碳二亚胺(DCCD)、对氯汞基苯(PCMB)作用于CF1，寡霉素作用于CF0(CF0下标的o就是表明其对寡霉素oligomycin敏感)。它们都抑制了ATP酶活性从而阻断光合磷酸化。
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