目前，核酸扩增试验（NAATs）是临床诊断的金标准，但大多数的NAATs是劳动密集和有限的特定的CT血清型。
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艰难梭菌毒素基因的核酸扩增实验(NAATs )如PCR，优于毒素A+B的酶免试验(EIAs)。NAATs可作为CDI的标准诊断。
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