短壳缝目共发现1属:短缝藻属(Eunotia),共23个分类单位,包括17种5变种1变型。
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Eunotia Ehrenberg 短缝藻属
Eunotia clevei Grunow 克氏短缝藻
Eunotia Ehr 短缝藻属
Pseudo-eunotia doliolusGrunow 鼓形伪短缝藻
Eunotia anhuiensis 安徽短缝藻
Eunotia monodon Ehrenberg 单齿短缝藻
Eunotia pectinalisRabenhorst var pectinalis 篦形短缝藻原变种
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