能量优化方法Energy Minimization Method即寻找研究体系能量极小的状态从数学角度看是处理多维函数的优化问题 常用的方法有1.直接搜寻法Direct Search Method2.最陡下降法Steepest Descent Method3共轭梯度法Cojugate Gradient Method4.拟牛顿法Quasi-Newton Method 能量优化方法的局限性1.该方法依赖于初始构型的选择即EM方法只能找到初始结构附近的局部极小结构2.体系不可能跨越较大的势垒因此EM不能找到全局极小 相比模拟退火方法Simulated Annealing通过体系升温然后再降温可使体系增加较大的动能从而使体系可以跨越较高的势垒而达到更低的能量构象因此模拟退火是寻找全局极小的较好方法