每个碱基对平行伸展并且与上面的和下面的碱基对非常靠近，这一现象叫做碱基堆积。
碱基堆积力(base stacking interaction) 相邻两个碱基对平面在旋进过程中会彼此重叠，由此产生了具有疏水性的碱基堆积力。
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5：双螺旋结构的作用力：（a）碱基堆积力（base-stacking forces） （b）互补碱 基对之间的氢键 （c）磷酸基上的负电荷与介质中的阳离子之间形成的离子键 6，tRNA 的二级结构 7：核酸的紫外吸收性...
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稳定双螺旋结构的力 量主要是邻近碱基平面间的碱基堆积力（ base stacking power ） , 即 Van der Wall's 力和疏水作用， 此外， 链 与链间碱基对所形成的氢键对稳定 DNA 双螺旋结构也 有重要作用。
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