有根树是具有方向的系统发生树(phylogenetic tree)，包含唯一的节点，将其作为树中所有物种的最近共同祖先。最常用的确定树根的方法是使用一个或多个无可争议的同源物种作为外群(outgroup)，这个外群要足够近，以提供足够的信息，但又不能太近以至于和树中的种类相混。
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得到的结果就是有根树。
在所有可能的有根树中，高度最小的称为最小高度树(MHT)。
Among all possible rooted trees, those with minimum height are called minimum height trees (MHTs).
该归档文件很可能创建为现有文件系统树的直接(局部)映像，所以自然可以用有根树表示。
This archive was probably created as the direct (partial) image of an existing filesystem tree, and is naturally represented by the rooted tree.
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