同时，也存在着一条不依赖Ku蛋白的非同源末端连接通路，称为微同源介导的末端连接（MMEJ）或选择性末端连接，这一通路通常会导致序列的缺失。尽管NHEJ和MMEJ时是针对不同的错误进行修复。
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微同源介导的末端连接
Micro-homology-mediated terminal connection
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