同源基因是由一个共同祖先在不同物种中遗传的基因。虽然同源基因在序列上是相似的，但相似的序列不一定是同源的
...wis称这种将身体一部份的构造变成另一相似构造的转变为“同源性的”(homeotic)转变，而其基因则称为“同源基因”(homeotic gene)。Lewis经多年的研究发现有一串的基因控制着果蝇体节的发育。
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同源基因 （homologous gene）指的是来自同一物种或不同但相关物种的、在进化过程中源于共同祖先的基因。它们彼此在核苷酸序列上是等同或相似的。
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垂直同源基因 (orthologous genes) 和 平行同源基因 (paralogous genes)： 垂直同源基因：不同物种间的同源性基因，编码的蛋白具相似或相同功能。
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We clone a 1.3kb promoter sequence of the homologous gene in Arabidopsis by PCR.
根据拟南芥的已知基因组序列，对拟南芥中的同源基因上游启动子序列设计引物，克隆到1.3kb的片段。
参考来源 - 拟南芥表皮毛特异表达启动子的克隆及功能分析Plant Na~+/H~+ antiporter genes were highly conservative, degenerate primers could be designed according to the conservative sequence of known Na~+/H~+ antiporter genes, and homologous gene could be cloned from other species.
植物的Na~+／H~+反向转运蛋白基因具有很高的保守性，根据已经报道的液泡膜Na~+／H~+反向转运蛋白基因的保守序列设计简并引物，可以从其它物种中分离同源基因。
参考来源 - 匍匐翦股颖离体再生体系的建立与遗传转化研究；匍匐翦股颖Na～+/H～+反向转运蛋白基因的克隆Homology search suggested that p93 is a distant family member of ILK(integrin-linked kinase).
同源性分析提示p93为整合素连接激酶(integrin-linked kinase，ILK)的远源同源基因。
参考来源 - 人心肌特异的新蛋白激酶p93在心脏发育、结构性心脏病中的功能与机制研究·2,447,543篇论文数据，部分数据来源于NoteExpress
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