《中国中医基础医学杂志》1995年创刊，是由国家中医药管理局主管，中国中医科学院中医基础理论研究所主办，以集中、快速反映我国中医基础理论研究最新成果、最新进展为特色的全国唯一一家中医理论研究期刊。杂志依托中国中医科学（研究）院和中医基础理论研究所雄厚的专业人才队伍，在导向中医基础理论研究，坚守中医理论阵地方面发挥了重要作用，成为中医理论研究、教学、科研、临床工作者认真关注的理论性研究期刊。对我国中医基础理论研究受重视程度的提高和研究队伍的扩大，起到了积极的促进作用。2011年版中文核心期刊。是中文核心期刊·中国医学类核心期刊，中国学术期刊数据库全文检索期刊，中国科学引文数据库扩展库期刊，中国生物学文摘和文献数据库期刊。2014年收录为”中国科技核心期刊“（中国科技论文统计源期刊）。