天南星科在亲缘关系上与百合科接近，可能从蜘蛛抱蛋族(Aspidistreae)演化而来，因为该族的开口箭属(Tupistra)、万年青属(Rohdea)都具有密集的穗状花序等特征，与本科的原始类群Lysichitum相似。
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