有关细胞的代谢网络可以分不同层次来讨论：基因组（DNA层次）、代谢途径及生化反应网络（蛋白质层次）、代谢流（物流层次）、代谢生理（微生物细胞层次）等等。对蛋白质层次的代谢网络来说，一个代谢物分子就是一个节点，而节点之间的连结则是生化反应。大部分的分子只参加一种或两种反应，但少数分子参与许多反应，它们实际上就是代谢流的集散中心或通用代谢物（currency metabolites）。
代谢网络（metabolic network）是将细胞内的所有生化反应表示为一个网络，反映了所有参与代谢过程的化合物之间及所有催化酶之间的相互作用。
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全基因组范围代谢网络 genome-scale metabolic network
新陈代谢网络 metabolic network
代谢网络优化 Metabolic network optimization
On the basis of these work, we coordinated some special genes and reactions in the network for the succedent research and the expand of the metabolic network.
在此工作的基础上,又进一步将代谢网络中一些特殊的基因和反应整理出来,以便于后续研究和代谢网络的扩展。
参考来源 - 枯草芽孢杆菌高质量代谢网络的初步构建With the rapid development of Systems Biology, new method for metabolic network modeling emerges. Systems Biology is the synergistic application of experiment, theory and modeling.
目前兴起的系统生物学研究,采用生物实验、理论和建模的进行综合分析,为代谢网络建模提供了新的手段。
参考来源 - 基于Petri网的生物代谢网络建模First, based on dynamic programming algorithm we designed a metabolic pathway approximate matching algorithm, in the KEGG metabolism network tried to find the nearest best match.
首先,基于动态规划算法设计一个代谢通路近似匹配算法,在KEGG的代谢网络中寻找距离最近的最佳匹配。
参考来源 - 基于KEGG的代谢通路最短路径问题的研究·2,447,543篇论文数据，部分数据来源于NoteExpress
这些酶都可能是在蔗糖代谢网络中起关键作用的。
These enzymes all possibly were in the sucrose metabolism network and made key functions.
但是在代谢网络背景下，其在改变氮同化和碳代谢中的生理功能还不是很清楚。
However, the basis of its physiological function that may alter the rate of nitrogen assimilation and carbon metabolism within the context of metabolic networks remains unclear.
代谢物间的相关性分析表明突变体根中特异存在色氨酸和其他主生代谢物间的代谢网络。
Metabolite-to-metabolite correlation analysis revealed the presence of mutant-specific networks between tryptamine and other primary metabolites in the roots.
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