玛嘉烈医院提供:
* 二十四小时急症
* 专科医疗护理
* 日间医护
* 复康服务
玛嘉烈医院现为香港肾科、传染病科、烧伤及整形外科的第三层转介中心,以及新界南区的脑神经外科 转介中心。玛嘉烈医院亦为区内其他医院提供诊断支援及专科应诊服务。
自2003年“SARS”后,特区政府与医管局全面检讨疫情,决定兴建传染病专科医疗中心,为传染病病人提供一站式的临床治疗,选址玛嘉烈医院,于2004年4月14日拨款5亿3,800万元展开兴建工程,于2006年第4季度竣工。2007年6月22日由卫生部部长高强及香港卫生福利及食物局局长
周一岳主持揭幕仪式。
传染病医疗中心位于玛嘉烈医院EF座大楼对开斜坡,楼高17层,楼面总面积达21,600平方米,其中8层是负气压隔离病房,提供108张隔离病床,其中14张为深切治疗病床。各病房以独立隔离病室组成,每个病室设一或两张病床,病房安装双重负压电动互锁门,并配以负压空调及高效能空气过滤系统。病房设独立更衣区(洁净与污染区),同时亦设有独立淋浴室与厕所,医疗中心的空气先经过高效能空气粒子过滤系统消毒才排放,而排污系统加设自动消毒系统,经消毒的污水才排放往公共污水渠。传染病中心设连接桥,贯通医院EF座、G座及P座大楼。
卫生防护中心设办公室于传染病中心内,中心设有生物安全第三等级临床实验室及放射诊断设施(包括X光机及电脑素描间)。