也叫初始减数分裂(initial meiosis),仅见于真菌和某些原核生物部分低等植物(如衣藻、团藻、丝藻、水绵和轮藻等)，减数分裂发生于两个正负配子产生后，及合子形成之后，形成单倍体的孢子，孢子通过有丝分裂产生新的单倍体后代。整个过程十分简单。

导致生殖母细胞中染色体数目减半的分裂过程（ 如右上角图图）。它是1883年由 E.van贝内登在动物和1888年由E.A.施特拉斯布格在植物最初发现的。在所有进行有性生殖的生物的生活史中，细胞除进行数次有丝分裂外，还要进行一次减数分裂，使其染色体数目由二倍体(2 n)变为单倍体（ n）。减数分裂发生在配子形成前的某一时期,所以雌雄配子的核都是单倍的。受精后形成的合子又成为二倍的。由于减数分裂，使每种生物代代都能够保持二倍体的染色体数目。在减数分裂过程中非同源染色体重新组合,同源染色体间发生部分交换,结果使配子的遗传基础多样化，使后代对环境条件的变化有更大的适应性。动物的减数分裂发生在形成配子之前。在雄性个体的精细管中，每个精母细胞通过减数分裂形成四个精细胞，精细胞分化成为精子。在雌性个体的卵巢中，卵母细胞通过减数分裂形成卵细胞。被子植物、裸子植物、蕨类和苔藓植物的生活史都由孢子体和配子体世代组成，减数分裂发生在孢子体世代的末尾。在被子植物的雄蕊花药中，小孢子母细胞通过减数分裂形成四个小孢子。小孢子经有丝分裂发育成雄配子体。雌蕊子房中的大孢子母细胞通过减数分裂形成大孢子。大孢子经有丝分裂发育成雌配子体。藻类和菌类进行减数分裂的时期依物种的不同而有多种情况。极端特殊情况见于水绵和衣藻，它们的配子结合（受精）形成合子，合子的第一次分裂就是减数分裂。