花紫色或白色，直径 2~4 公分。花萼筒状，紫色，萼片长约 0.3 公分；花瓣开展，长 1~1.5 公分，有细脉纹，爪部长 0.3~0.6 公分。
叶形变化大，基生叶和下部茎生叶大头羽状分裂，顶裂片近圆形或卵形，长 3~7 公分，高 2~3.5 公分，基部心形，有钝齿；侧裂片 2~6 对，卵形或三角状卵形，长 0.3~1.5 公分，越向下越小，全缘或具锯齿，偶在叶轴上杂有极小裂片；叶柄长 2~4 公分；上部茎生叶长圆形或窄卵形，长 4~9 公分，基部耳状，抱茎，边缘有不整齐锯齿。
长角果，线形，长 0.7~10 公分，具 4 稜，裂瓣有 1 条中脉，喙长 1.5~2.5 公分。种子卵形至长圆形，长约 0.2 公分，黑棕色。花、果期 4~6 月。
一、二年生草本。株高 10~50 公分，全体无毛；茎单一，直立。叶形变化大，基生叶和下部茎生叶大头羽状分裂，顶裂片近圆形或卵形，长 3~7 公分，高 2~3.5 公分，基部心形，有钝齿；侧裂片 2~6 对，卵形或三角状卵形，长 0.3~1.5 公分，越向下越小，全缘或具锯齿，偶在叶轴上杂有极小裂片；叶柄长 2~4 公分；上部茎生叶长圆形或窄卵形，长 4~9 公分，基部耳状，抱茎，边缘有不整齐锯齿。花紫色或白色，直径 2~4 公分。花萼筒状，紫色，萼片长约 0.3 公分；花瓣开展，长 1~1.5 公分，有细脉纹，爪部长 0.3~0.6 公分。长角果，线形，长 0.7~10 公分，具 4 稜，裂瓣有 1 条中脉，喙长 1.5~2.5 公分。种子卵形至长圆形，长约 0.2 公分，黑棕色。花、果期 4~6 月。
诸葛菜株高20～70cm，一般多为30～50cm。茎直立且仅有单一茎。基生叶和下部茎生叶羽状深裂，叶基心形，叶缘有钝齿；上部茎生叶长圆形或窄卵形，叶基抱茎呈耳状，叶缘有不整齐的锯齿状结构。 总状花序顶生，着生5～20朵，花瓣中有幼细的脉纹，花多为蓝紫色或淡红色，随着花期的延续，花色逐渐转淡，最终变为白色。花期4～5月份，果期5～6月份。花瓣4枚，长卵形，具长爪，爪长约3～6mm，花瓣长度约1～2cm；雄蕊6枚，花丝白色，花药黄色；花萼细长呈筒状，色蓝紫，萼片长3mm左右。果实为长角果圆柱形，长6～9cm，角果的顶端有细长的喙，果实具有四条棱，内有大量细小的黑褐色种子，种子卵形圆形，果实成熟后会自然开裂，弹出种子。
