DNA 复制、转录、修复、重组在染色质水平发生，这些过程中，染色质重塑可导致核小体位置和结构的变化，引起染色质变化。ATP 依赖的染色质重塑因子可重新定位核小体，改变核小体结构，共价修饰组蛋白。重塑包括多种变化，一般指染色质特定区域对核酶稳定性的变化。人们发现体内染色质结构重塑存在于基因启动子中，转录因子TF 以及染色质重塑因子与启动子上特定位点结合，引起特定核小体位置的改变（滑动），或核小体三维结构的改变，或二者兼有，它们都能改变染色质对核酶的敏感性。关于重塑因子调节基因表达机制的假设有两种： 机制1） 1 个转录因子独立地与核小体DNA 结合（DNA 可以是核小体或核小体之间的），然后，这个转录因子再结合1 个重塑因子，导致附近核小体结构发生稳定性的变化，又导致其他转录因子的结合，这是一个串联反应的过程； 机制2） 由重塑因子首先独立地与核小体结合，不改变其结构，但使其松动并发生滑动，这将导致转录因子的结合，从而使新形成的无核小体的区域稳定。

在核小体重塑过程中，重塑因子复合物的作用非常重要。这些复合物都具有ATP酶活性。SW IöSN F复合物和ISW I 复合物家族是最先从酵母和果蝇体内发现的两种。SW IöSN F 中的组分BRG1、hBRM 和ISW I相关复合物的组分H snf2L、H snf2h 具有A TP 酶活性。人的SW IöSN F 复合物是1 个有很多分子的聚合物，包含BRG1 或hBMR 和肿瘤抑制蛋白H snf5öV I21，它主要激活基因转录，还与免疫球蛋白，TCR 基因重组有关。ISW I 复合物家族包括RSF、HuCHRAC、CA F1 3个复合物。RSF是1个异二聚体，组分包括H snf-h，主要参与转录起始： HucHRAC 含有H snf2h 和染色质组装因子Hacf1，与异染色质的复制状态维持有关； CA F1参与染色质组装，改变染色质的状态，使其与DNA功能相关。实验证明：BRG1、Hbrm、H snf-h、M i 都显示了A TP 酶的活性。此外，体外实验证明： SW 2öSN F复合物和ISW I 相关复合物的作用机制存在很大差别。ISW I 相关复合物只识别核小体,而SW IöSN F 复合物识别核小体和裸露的DNA，亲和力高，通过与DNA 作用，可移动核小体，产生更易被影响的DNA 区域，且SW IöSN F 的作用不受组蛋白N 端或C 端修饰的影响。

染色质重组过程中，核小体滑动可能是一种重要机制，它不改变核小体结构，但改变核小体与DNA 的结合位置。实验证明，这种滑动能被核小体上游的“十字形”结构阻断。但“滑动”机制并不能解释所有实验现象。人们推测，在重组过程中，还有其他机制如核小体可能与DNA 分离，然后核小体经过重排，结构变化后，与DNA 重新组装，产生新的结构形式，整个过程是可逆的，受其他因子调节，某些因子可决定反应进行方向。