《神农本草经疏》,又名《本草经疏》。全书三十卷，卷一、二为《续序例》上、下，论述药物的性味主治等内容，载有医论30余篇，将药物与辨证结合论述，分列诸病应忌药七门（即阴阳表里虚实、五脏六腑虚实、六淫、杂证、妇人、小儿、外科）。
卷三～卷二十九，依《证类本草》编次，将部分《证类本草》中药物分别用注疏的形式，加以发挥。各药主治多遵《本经》、《别录》,若两书不详，再参以诸家论治；每药之后又附有“主治参互”和“简误”两项，来考证药效及处方、宜忌等。其末卷收载《证类本草》未载或未详之药。