余文权工作期间先后参加了《福建省名优茶开发》、《福建省无公害茶园建设》和《茶树无性系栽培及机械化采茶》等项目，获农业部丰收奖二项，省科技进步奖一项；参与制订《铁观音茶》、《窨茶用茉莉花无公害食品》标准，参与实施全省有机茶和无公害茶叶产品开发，参与主持全省名优茶开发活动，参与茶树新品种的繁育推广工作，积极开展茶叶降低农残工作，参与主持召开全国无公害生产技术培训班和全省有机茶生产现场会，参与举办名优茶机制、无公害茶叶生产等专项技术培训，积极参与茶叶主产区的规划与建设，在《中国茶叶》、《福建茶叶》、《茶叶科学技术》、《农民日报》等专业刊物和报刊上发表有关茶叶论文和文章20余篇；主笔编写《福建茶叶竞争力分析与财政扶持政策》、《福建茶叶强省规划》、《茶叶优势区域规划》等茶叶产业布局与规划专题报告，推动了全省茶产业的发展。荣获科技部“2005～2006年度全国市(县)科技进步工作先进个人”称号。
余文权在任职安溪科技副县长期间，主动参与安溪生态茶园建设、万人培训工程和农残整治工作，推动企业自主创新，提升科技水平，宏扬茶文化，为安溪茶产业发展献计献策，力求作为。
2012年9月26日，公示担任福建省农科院副院长。