东方虽然历史悠久，著名足球员及评述员林尚义当年所效力的第一个球会正是东方，但除了1955-56夺得甲组联赛及高级银牌双料冠军，大部分时间成绩均处于中下游，经常受到降班威胁，因此在1960至70年代曾有“大家慌”外号。
在1980年代初期，林建岳与钟立全入阁东方，组成劲旅参战，先后成功夺得高级银牌、总督杯与足总杯当时本地三大杯赛冠军，却始终未能重夺甲组联赛冠军。1984年更因解雇德国外援纽尼斯，遭纽尼斯告上国际足协，被判巨额罚款。后来林建岳带兵上山任南华足球部主任，东方又再回复“青春班”。
1990-91年度球季如束后，丽新宣布退出，东方接收其华人及外援班底，实力顿时大为增强，首季(1991-92年度)即夺得甲组联赛亚军，由1992-93年度球季起，连夺三届甲组联赛冠军，1992-93及1993-94两届更成为“三冠王”，创出球会史上最佳成绩，被称为“东方皇朝”。
2002-03球季，东方在乙组联赛10支球队位列包尾，首次降落丙组作赛。
2004-05球季，东方获得丙组联赛总亚军，与总冠军德高朋友一同升上乙组作赛。
2006-07球季，2006-07赛季的香港乙组足球联赛中，以20战5胜4和11负得19分排尾二，依例来季要降落香港丙组(甲)足球联赛角逐。但由于深圳上清饮放弃来港角逐香港甲组足球联赛，东方应香港足球总会主席梁孔德之邀请，在2007-08球季重返香港甲组足球联赛角逐。东方曾一度因组军时间仓卒而婉拒邀请，其后香港足球总会主席梁孔德找来了600万港元巨额赞助，东方最终决定接受邀请，重返香港甲组足球联赛。
东方找来了南华三冠王教练米路出任教练，梁承杰与岑国培出任助教，亦获南华、愉园、杰志及康宏晨曦等多支球队借出球员成军，并在巴西物色外援加盟。在米路出色的带领下，配合卢斯奥、洛迪高等球员的优异演出，在2007年12月23日银牌决赛，以3-1击败杰志，重返甲组第一项淘汰赛便夺得冠军。