作品起因
这部作品会出现的起因主要是在2004年末，导演庵野秀明向EVA机设的山下いくと聊起今后EVA的各种构想开始。而其中一种构想就是希望让EVA像《高达》那样多元化。听到这话的山下也随性跟庵野说起他曾经有想过原创的EVA企划，那是跳脱EVA原本的故事型态“偏向科幻作品那样、朝着宇宙前进” 这样的内容。
庵野就对山下说随你去做吧，反正贞本那边（漫画）也在随自己意思画了，使用EVA的标题也可以，这样干脆的放手让山下去玩。
其结果就是现在这个《ANIMA》，以山下いくと为总指挥兼机设、曾经做过动画板原画与在同人界各方面都出名的うたたねひろゆき来做人设、以及架空战记作家，以对战车很有爱的阴山琢磨来执笔。
《ANIMA》，是指“灵魂所在”。
故事背景
《ANIMA》的故事设定。是以“人类补完计划'没有发动的世界3年后作为舞台。主要剧情分歧点在于TV板24话完结的时候，从这个点开始与旧剧场板新25、26话走向不同的剧情进展。24话结束时分歧故事是日WiKi的资料，因为来源不明所以只能认为该WiKi笔者是以24话是渚薫死亡才作此判断。而内容最主要分歧点，其实持的努力成果最大关键，一切都是以他逃过谍报部的追杀，活下来揭露SEELE的内幕给国联和日本政府，故事才因此整个大转弯。进而导致SEELE所发动的人类补完计划失败，全人类都活下来的世界，以及真嗣他们17岁开始的崭新故事。
因为NERV特殊调查部所属的加持的活跃，SEELE打算用战略自卫队强制占领NERV、使用EVA量产机强制执行人类补完计划的事全都在事前就被察觉。
SEELE打算执行“人类补完计划”，以及其计划的全貌内容（全人类变LCL）这两件事冲击了国联和日本政府，预定要侵攻NERV日本本部的战略自卫队被介入中止。
不过因为内部有SEELE的间牒的关系，国连与日本政府陷入了混乱状态，在支援对策迟迟无法决定的情况下，NERV日本本部只能独力应对不知何时会造访的与SEELE的决战。
得知SEELE的奇袭战力是九架量产机和复制的朗机努司之枪，对于目前NERV日本本部只有初号机能迎击，零号机再生中、二号机驾驶精神崩溃的情况，可说是很绝望的战力差。
于是，NERV日本本部只好开始加速实用化原本因为SEELE怕造反而阻止、冻结的「AT领域制御用实验机－通称F型EVA」的研究。
在初号机与零号机换上F型装备时，量产机来袭了。这时原本为了避难而丢到湖底的二号机和明日香，因发现二号机中着"母亲"而觉醒，并且紧急应对量产机。不过结果还是旧剧场版一样，AT力场抵挡不了量产机所拥有的复制版朗努基斯之枪，二号机被爆头钉在地上。
在这个关键时刻，F型EVA；初号机与零号机就赶来救援，二号机才没有遭受量产机啃食。
人物简介
第三适格者
就读第三新东京市立第一高等学校的17岁少年，同时也是初号机的驾驶员。三年后的他长高许多， 已经不像14岁的时候一样老是绝望与自卑了，成长成了连美里也认为是"很棒的男人"，甚至在班上担任班长。彷佛要模仿加持一般的留长发并束马尾，虽然个性并没有跟著越来越像加持，但给人的气质上却能感受出那种"可靠"的感觉。兴趣是种西瓜，看来受加持荼毒很深...
绫波零（第三人/No.トロワ）
第一适格者
就读第三新东京市立第一高等学校的17岁少女，同时也是零号机的驾驶员。虽然是第三人，但经过三年洗礼后，个性也变的比较像个人了。三年后与三年前最大的差别就－－她有在看小说。她能够与其他三位绫波克隆体做零时差的精神连结与知觉同调。不过身为本体的她，在让其他的绫波零活动时，身体会有很大的负担。为此零比以前还要更常带著EVA用的神经连接专用耳机（头上很像猫耳的那个）。身边更是会带著名为「ニャンキチ」的传感机器人，用於将零脑内突触神经的情报连接传送至NERV本部。因为量产成四只的关系，他的戏分都被其他三只抢很大。（不过四只都是"绫波零"，从这个角度来看，"绫波零"或许是戏份最多的也说不定。）做为区别，有时会被称呼为 No.トロワ (trois），也就是法语的3。
惣流/式波·明日香·兰格雷
第二适格者
NERV日本本部防卫战那次觉醒之后，近乎失去的EVA驾驶资格也拿回来了。
原本嚣张的个性也圆润许多。与绫波零也不再如此针眼相对。
虽说绫波（第三人）发育良好，但是依然赢不过明日香啊XD
明日香甚至还对美里说"别再用我胸部成长的老梗（neta）了啦！"
同时对于防卫战战中前来拯救他的真嗣非常感谢，甚至在真嗣身上看到加持的身影。
铃原冬二
第四适格者
就读第三新东京市立第一高等学校的17岁少年。虽然因为使徒引起的三号机暴走事故而负伤，但靠着生体组织与人造义肢而复归。因为与不好相触&；不易亲近人的各个EVA驾驶员都沟通得很不错，所以被委任 NERV JAN付司令代理，尽管那关西幽默偶尔会大大冷场。也因为是第四适格者的关系，平时也替EVA器材做实验协力。
神秘的第五适任者现身，真是跌破眼镜
虽然没有明确指出是谁，但是这个形象八成是班长洞木光
未来大概可以和老公（官配）使出你侬我侬合体攻击。
NERV JAN总司令。32岁
战略自卫队的阶级是准将。
原总司令碇源堂在本部攻防战中被封在地底都市被认定KIA（死亡）而在三年间担任了司令代理，后来正式晋升为总司令。将NERV从「神秘主义的科学宗教组织」改组成NERV JAN这种「与其他组织比较有往来（=比较不会被欺负）、在大众印象中比较好的正式组织」也是她的提议。现在可说是「NERV JAN」目前最核心的人物。
伊吹摩耶
NERV JAN的技术开发部技术局一课负责人。
战略自卫队的阶级是三佐。
统括了在攻防战中被封在地底都市认定KIA（死亡）的前辈赤木律子负责的所有任务与技术。EVA开发也是他在负责。与三年前不同的是她带了眼镜，那是前辈赤木律子的遗物。表面上继承律子的技术部目前最核心的人，然而私底下那脆弱的心依旧.........
加持良治
NERV JAN的防谍部所属。
三年前事前察知SEELE要侵略NERV的事，并以人类补完计画内容劝诱日本政丨防和谐丨府阻止战略自卫队侵入的功劳者。为了搜索潜到暗地的 SEELE残党，而与相田剑介在世界各国旅行著。
冬月幸增
旧NERV日本本部副司令。
在旧NERV解体时，因为隐瞒「人类补玩计划」等情报而处以国家叛逆罪而入狱。一年后因为生病疗养而出狱、回到京都隐居。葛城美理司令是NERV JPN的核心人物，但冬月则是NERV大多数人的精神支柱。
