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RT-PCR技术
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简介
RT- PCR首先经
反转录酶
的作用以RNA合成 cDNA,再以
cDNA
为模板,扩增合成目的片段。RT-PCR技术灵敏而且用途广泛,可用于检测细胞中
基因表达
水平、细胞中RNA病毒的含量和直接克隆特定基因的cDNA序列。作为模板的RNA可以是总RNA、mRNA或
体外转录
的RNA产物。无论使用何种RNA,关键是确保RNA中无RNA酶和基因组 DNA的污染。
用于
反转录
的
引物
可视实验的具体情况选择
随机引物
、Oligo dT 及基因特异性引物中的一种。对于短的不具有
发卡结构
的真核细胞mRNA,三种都可。
引物选择
随机引物
适用于长的或具有发卡结构的RNA。适用于rRNA、mRNA、tRNA 等所有RNA的反转录反应。主要用于单一模板的RT-PCR反应。
Oligo dT
适用于具有PolyA尾巴的RNA。(原核生物的RNA、真核生物的 Oligo dT rRNA和tRNA不具有PolyA尾巴。)由于Oligo dT要结合到PolyA 尾巴上,所以对RNA样品的质量要求较高,即使有少量降解也会使全长cDNA合成量大大减少。
基因特异性引物
与模板序列互补的引物,适用于目的序列已知的情况。
操作流程
RT-PCR反应原理
1.从细胞或特定组织中提取总RNA;
2.逆转录实验;
3.扩增内参和目的基因并比较基因表达差异。
影响因素
RT-PCR反应受多个因素影响,如硫酸镁的浓度, 引物退火的温度,扩增的循环数等。
◇建议选择0.5-3.0 mM (相差0.5 mM)的硫酸镁作初步实验。
◇对于具有较高Tm的引物,增加退火和延伸时的温度对反应有利。较高的温度有利于减少非特异的引物结合,因而提高特异产物的得率。
◇大多数目标RNA经40轮PCR反应就能观察到。但如果目标RNA太稀少,或者只有很少的起始材料,有必要增加扩增的次数到45-50次。
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- 来自原声例句
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