保护对象
古红花尔基樟子松林国家级自然保护区保护对象是沙地樟子松森林生态系统。
植物资源
保护区区域内共有植物74科,302属,682种。其中,木本植物49种,常见药用植物100余种,约占大兴安岭药用植物种数的40%,食用浆果类、坚果类有10余种,红花尔基樟子松林国家级自然保护区植物种类相对较多,在大兴安岭南段西坡具有较高的代表性。除主体保护对象长子松是国家二级珍贵树种外,还有三级保护植物黄芪、草苁蓉等。
保护区内野生食用菌种类统计有80余种,具有较高经济价值和药用价值的食用菌10余种之多,主要有蒙古口磨、
铆钉菇、鸡油磨、
大白桩菇等。
动物资源
经内蒙古自治区野生动物调查队1999年野外调查确认,有记录230种脊椎动物,分属31目64科,占内蒙古脊椎动物总数的53%,其中兽类有54种,隶属6目16科,占内蒙古兽类总数的39%;鸟类161种,隶属17目37科,占内蒙古鸟类436种的37%。
有国家一级重点保护兽类1种,国家2级重点保护兽类8种,占内蒙古保护种数的30%。有国家一级重点保护鸟类5种,二级重点保护鸟类37种。保护区内有鱼类7种,隶属5科。昆虫种类共126种,有收藏价值及观赏价值的绿带碧凤蝶和黄凤蝶。
注:以上数据截至2013年