除建筑系、医学院等少部分院系外，绝大部分一至三年级本科生教育全部搬到九龙湖校区；
部分院系的四年级本科生与研究生搬至九龙湖校区；
为本科教育服务的基础实验室、专业基础实验室，部分为高层次人才培养和科研服务的专业实验室搬迁至九龙湖校区。 二、三期调整安排
时间安排为2005-2015年，二、三期工程建成，基本完成校区归并和功能调整：
全部的全日制本科教育集中在九龙湖校区，其他校区不再承担本科教育功能；
除少数专业学位等特殊情况，研究生教育基本上在九龙湖校区完成；
大部分科研实验室和研究基地入驻九龙湖校区。
学生规模
九龙湖校区一期学生规模为本科生12000左右；研究生3400人，其中博士生900人。
二、三期完成后学生总规模在3.2万人左右，其中本科生2万人，研究生1.2万人。