疫疠所致之病证种类很多，但临床常见的主要有瘟疫、疫疹、瘟黄等证候。
1.瘟疫是感受疫疠之气而发生的急性、流行性传染病。主要临床表现：初起憎寒而后发热，头身疼痛，胸痞呕恶，日后但热而不憎寒，昼夜发热，日哺益甚，苔白如积粉，脉数。若不及时救治，死亡率高。
病机分析：疫毒伏于膜原，邪正相争于半表半里，故初起憎寒而后发热，头身疼痛。瘟疫病毒，秽浊蕴积于内，气机壅滞，故见胸痞呕恶，苔白如积粉等症状；疫邪日久，化热入里，故见但热而不憎寒，昼夜发热，脉数等症状。
2.疫疹是指在瘟疫过程中热毒侵入血分，迫血外溢而出现发疹病证。主要临床表现：初起发热遍体炎热，头痛如劈，斑疹透露，或红或赤，或紫或黑，脉数。如果初起六脉细数沉伏，面色青，昏愦如迷，四肢逆冷，头汗如雨，头痛如劈，腹内绞痛，欲吐不吐，欲泄不泄，摇头鼓颔为闷疫。
病机分析：疫疹之外发斑疹，是因为外感疫毒之邪侵入血分，外发于肌肤所致；疫毒之邪充斥表里，故初起见发热，遍体炎热，头痛如劈；疫疹脉数，为毒热郁蒸之象。如果脉浮大而数，表明邪不太深，正能胜邪，可驱邪外出；如果脉沉细数，表明邪毒深入，正不能胜邪，邪热闹伏于里；如果脉不浮不沉而数者，表明为热毒陷于半表半里之间的证候。如热毒深伏于里，不能发露于外，则见闷疫之证；疫毒不外达，故见六脉细数沉伏，面色青，热盛神昏，故昏债如迷，热深厥亦深，故四肢逆冷，火毒上攻，故头汗如雨，头痛如劈，腹中绞痛，欲吐不吐，欲泄不泄，甚则摇头鼓颔等症，皆为疫毒伏于里，不能畅达于外之象。
3.瘟黄是因感受瘟毒夹有湿热而引起的卒然发病的病证。主要临床表现：初起可见发热恶寒，随即卒然发黄，全身皮肤、齿垢、眼白黄色深，名急黄。疫毒深重则变证蜂起，或四肢逆冷，或神昏谵语，或直视，或遗尿，甚至舌卷囊缩，循衣摸床，难以挽救。