环保中国产业联盟下设联盟代表大会、联盟秘书处、专业委员会等机构。
联盟代表大会
联盟代表大会由联盟各成员单位组成,起草并决议通过联盟的各项议程。
联盟秘书处
联盟秘书处由秘书长领导日常工作,下设发展研究中心、对外合作中心、公关中心、媒介中心、后勤保障中心、志愿者中心等机构,负责联盟日常工作的正常运行。
联盟专业委员会
联盟专业委员会分为大气污染防治专业委员会、水污染防治专业委员会、噪音污染防治专业委员会、固体废弃物专业委员会、环境影响评价专业委员会、环境监测专业委员会、新能源专业委员会、新材料专业委员会、CDM专业委员会、环保微生物专业委员会等多个专业委员会,负责专项技术研究。
联盟媒体
联盟拥有两大环保强势媒体,“环保中国”网和《环保中国》杂志,相关日常工作由媒介中心负责。