深圳音乐厅由演奏大厅、小剧场和其他附属设施组成。
演奏大厅呈峡谷梯田式,中为岛式舞台,主要用于演奏交响乐,总面积2,323平方米。舞台面积251平方米,台口宽21米、深16米,可供四管编制的交响乐团和300人混声合唱团同台演出。演奏台由固定舞台和36块升降台板组成。根据各种乐器配备的乐团摆位要求,舞台可升降不同台板的高度,以满足乐团分层次的阶梯式演奏及大型合唱团的排列需求。
大厅观众席设有1,680座,值得一提的是座椅之间的行距宽敞舒适,设计为1.05米。另外60个贵宾座椅行距更设计为罕见的1.3米,令观众在欣赏演出的同时,身心得到极大的放松。
演奏大厅的建筑声学由日本永田音响公司设计,但为了配合其他类型演出需求,特地由国际知名扩声专家设计了辅助的电声系统。
小剧场位于观众入口大厅上方,为14.4米高空悬挂式演出厅。总面积629平方米,观众席分为三层。舞台由20块升降台和2块车载旋转台组成,特别是国际上最前卫的实验剧目的演出。根据舞台台面的变化,观众席位可由400座调至580座。