普通鸣冠雉以往是包含所有鸣冠雉的亚种。但经过粒线体DNA、骨学及
生物地理学的分析确定了这些亚种其实是独立物种,加上
肉垂冠雉较为接近
黑额鸣冠雉,故建议合并这两个属。另外,
蓝喉鸣冠雉是普通鸣冠雉的最近亲,约于40万年前,或更早的160万年前分支开来。由于特立尼达是自
第四纪冰期才成为一个岛屿,故此估计普通鸣冠雉是在
南美洲大陆上演化,并于较近期才被带到特立尼达。一般认为普通鸣冠雉的完模标本并非在委内瑞拉近库马纳的奥里诺科河发现的,但是这个位置相对特立尼达,令这个说法变得可能正确,而普通鸣冠雉可能是约于1800年才在委内瑞拉消失。