完全混合曝气法其运转过程是：将污水与一定量的回流污泥（作接种用）混合后流入曝气池，在通气翼轮或压缩空气分布管不断充气、搅拌下，与池内正在处理的污水充分混合并得到良好的稀释，于是污水中的有机物和毒物就被活性污泥中的好氧微生物群所降解、氧化和吸附，微生物群也同时获得了营养并进行生长繁殖。经一段滞留时间后多余的水经溢流方式连续流入一旁或外围的沉淀池。在沉淀池中，由于没有通气和搅拌，故在处理后的清水不断溢出沉淀池的同时，活性污泥团纷纷沉入池底，待积集到一定程度时，再进行污泥排放。污泥可进一步作厌氧消化处理。